Atelier Introduction au traitement et à l'analyse des bio-images avec Fiji/ImageJ

Organisé par les plateformes de microscopie RISEst et Alsace FBI Node.

RISEst et Alsace FBI Node organisent des ateliers "Introduction au traitement et à l'analyse des bio-images avec Fiji/ImageJ" les mardi 29 octobre et mercredi 30 octobre (en anglais) ouvert à toutes et tous (ITA, PhD, CR, DR, etc.).

Programme préliminaire:

  • Introduction aux propriétés d'une image numérique
  • Qu'est-ce que ImageJ/Fiji
  • Ouvrir, importer, sauvegarder et exporter des images
  •  Les différents paramètres d'une image (résolution, 3D, 4D, temps, canaux, etc.)
  •  La manipulation d'une pile d'image
  • Les opérations sur le contraste et la luminosité
  • Sélection et régions d'intérêt
  • Les différentes types de mesures 
  • Segmentation des images (seuillage, apprentissage machine, apprentissage profond, etc.)
  • Automatiser les protocoles avec le langage de script Macro ImageJ
  • Utiliser des plugins

Pré-requis: savoir utiliser un ordinateur

Lieu: salle informatique B100, Faculté de Pharmacie, Illkirch

Langue: anglais (formateurs francophones)

Sessions: L'atelier est réparti sur 2 journées

Frais d'inscription: gratuit

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